孙承宗坚信袁崇焕能旗开得胜，打败努尔哈赤七万铁骑。袁崇焕站在城楼，仔细查看两军的战况，明军越战越勇，打退了努尔哈赤的部队一次又一次地进攻。皇太极带人越过大炮的死角地带，将士们用盾牌作掩护，齐心协力凿城墙，祖大寿用石头拼命砸向他们，可是盾牌防护严密，丝毫不能动摇他们的防卫，祖大寿立刻拿来弓箭，试图从缝隙里射穿他们，可是根本射不透，眼看城墙即将被凿开，袁崇焕立刻派赵率教带预备队到城下守卫，绝不许任何一个金军进城。

皇太极的部队很快凿穿了四个大洞，努尔哈赤下令全线出击，袁崇焕集中大炮火力，全力阻挡大军的进攻，程本直和孙灵汐也来到城墙，孙灵汐提议把火药直接倒下去，然后点燃，就可以阻止金军凿墙，袁崇焕立刻下令倾倒火药，并让大炮阻止努尔哈赤的大军靠近，孙灵汐亲自到城楼指挥，火药迅速燃烧，金军被烧得鬼哭狼嚎，狼狈逃窜，皇太极的计划彻底泡汤，他气得大呼小叫，努尔哈赤眼看大势已去，只好带兵撤退。

金军伤亡惨重，不但损兵折将，还损失了很多武器弹药，代善自愿承担一切罪责，努尔哈赤不甘心，决定带兵攻打南门，皇太极当场提出异议，可努尔哈赤心意已决。袁崇焕带领将士们稍事休息，程本直断定努尔哈赤不会善罢甘休，下午的战事会更加惨烈，程本直断定努尔哈赤一定会主攻南门，祖大寿信心百倍，要与南门共存亡，孙灵汐特意准备了热粥给将士们暖身体，不许他们吃冷的干粮。

努尔哈赤率队卷土重来，集中火力攻打南门，还利用器械向城楼抛石块，祖大寿带领战士们奋勇还击，可是金军的火力强劲，明军死伤无数，祖大寿只好先让将士们躲起来，金军很快冲到城楼下，并支起长梯准备登程，祖大寿让大家向下滚木礌石，打退了一次又一次的进攻，努尔哈赤一声令下，金军全线出击，一起向宁远城进发。

金军破门而入，一部分人进了城门，就在这时，一个巨大的栅栏挡住城门，金军被困在里面，赵率教带领明军和金军展开肉搏战，很快将他们全部杀死。努尔哈赤只好带队撤走，他气得火冒三丈，向范文程询问对付袁崇焕的对策，范文程决定连夜攻城，还要修书一封，利用袁崇焕父亲的死来动摇他的军心。

袁崇焕很快就接到努尔哈赤的信，他在信里谴责袁崇焕不孝，孙灵汐很担心，袁崇焕看完信，立刻集合所有的将士，当众宣读了努尔哈赤的信，袁崇焕鼓舞大家誓死坚守宁远城，绝不后退，袁崇焕也做好了和努尔哈赤鱼死网破的准备。孙灵汐连夜给将士们送来棉被，让大家原地休息，她亲手给袁崇焕盖上棉被，突然城外飞来一只箭，射中了孙灵汐，袁崇焕让小兰照顾孙灵汐，他急忙叫醒将士们，准备和努尔哈赤决一死战。

孙承宗彻夜难眠，他惦记着袁崇焕前方战事，连夜写了两封一模一样的奏折，想替袁崇焕在朝中斡旋，梁廷栋一直守在旁边照顾孙承宗，他坚信袁崇焕会旗开得胜，即使袁崇焕打了败仗，梁廷栋也会竭尽全力帮袁崇焕。努尔哈赤连夜带兵攻打宁远城的西门，他下了死命令，即使步兵全部战死，他会让骑兵全力冲上前。满桂带队前来支援，明军苦撑了一夜，金军始终没有攻破城门。

第二天一早，代善提议再一次攻城，皇太极却提议撤兵，两军交战一天一夜，金军伤亡惨重，如果再不撤退，努尔哈赤多年的心血就伤亡殆尽了，莽古尔泰坚决不干，还对皇太极大呼小叫，努尔哈赤当场决定暂时休整，再重整旗鼓。祖大寿清点了剩下的将士，已经不足八百人，而且弹药也用光了，满桂表示誓死坚守宁远城，祖大寿，谢尚政一致提出和袁崇焕并肩作战到最后一刻，袁崇焕发誓与宁远共存亡。